국내 10개 대학병원의 당뇨병 임상전문가들로 구성된 한국인 당뇨병 유전체 연구 컨소시엄을 구성하여, 주로 자가면역기전에 의한 췌장소도세포 파괴에 의한 제 1형 당뇨병과 인슐린 분비 및 작용의 이상에 기인한 제 2형 당뇨병 환자의 임상정보와 DNA 시료를 확보한다.

제 1형 당뇨병의 경우는 유병율이 낮기 때문에 1단계는 제 1형 당뇨병 등록사업에 이미 등록되어 있는 환자와 그 가족(200가족)들을 대상으로 하며, 2단계는 참여병원에서 새로이 진단 받게되는 제 1형 당뇨병 환자와 그 가족을 대상으로 한다.

제 2형 당뇨병의 경우 가족구성원 중 당뇨병 환자가 2명 이상 있는 600가족을 대상으로 한다. 1단계에서는 당뇨병의 표현형을 정의하기 위해 비만도, 체지방 분포, 인슐린 분비능, 인슐린 감수성, 췌장소도 특이항체 및 각종 대사지표 등을 평가하며, 생활습관에 의한 영향을 평가하기 위한 설문조사도 병행한다. 그리고 당뇨병 환자와 그 가족의 DNA 시료와 불멸화된 B-cell line을 확보한다.

2단계에서는 당뇨병 발생 고위험군의 임상정보와 DNA 시료를 확보하고, 이들을 추적관찰하면서 당뇨병으로의 전환되는 군과 그렇지 않은 군으로 나누어 비교 분석한다. 또한 합병증의 발병 및 치료반응성에 따른 차이 등을 연구하기 위해 당뇨병 환자군의 임상 정보와 DNA 시료를 확보한다.

한국인 제 1형 당뇨병 환자와 직계가족, 그리고 정상 대조군에서 지금까지 알려진 면역유전학적 표지자 및 기능상의 후보유전자를 검색하며 새로운 유전학적 표지자를 개발한다. 제 1형 당뇨병의 고위험군에서 발굴된 유전표지자를 검증하여 발병전 표지자를 개발하고, 이를 토대로 유전자 치료와 면역요법 등을 연구하여 제 1형 당뇨병을 예방하는 방법을 개발한다.

우선적으로 다양한 특성을 가지는 가계 중에서 동질 표현형군으로 분류된 사람들을 대상으로 제 2형 당뇨병 발병의 유전적 소인으로 알려진 후보 유전자와 제 4, 5 세부과제 중 혹은 다른 연구팀에 의해 발견되는 새 후보유전자의 cSNP를 우선적으로 검색함으로써 제 2형 당뇨병의 유전적 원인을 분석하고자 한다.

cSNP의 검색방법으로는 자동화 염기서열 분석과 함께 저비용 고효율방식인 two dimensional gene scanning 방법을 병행한다. 발굴된 cSNP를 토대로 진단, 합병증 및 치료반응성을 예측할 수 있는 DNA chip을 제작하고 이를 당뇨병 환자 또는 고위험군의 유전체 분석을 통해 검증한다.

초기에는 당뇨병 환자와 정상 대조군으로부터 근육, 지방조직 및 췌장조직을 얻거나 세포주 모델을 이용하여 시판중인 cDNA microarray chip으로써 유전자발현 변화를 검색한다. 그리고 그 결과 발굴된 새로운 유전자를 연구하여 한국인에서 고유한 당뇨병 관련 유전체를 발굴하고 그 기능을 연구하며, 한국인 당뇨병 진단을 위한 master DNA chip을 제작한다. 또한 인슐린 분비능, 인슐린 저항성, 합병증 진단을 위하여 각각 50개 미만의 유전자를 지닌 DNA chip을 제작 활용한다.

Proteomics 신기술을 이용하여 당뇨병 발병 혹은 합병증이 발생할 때 과다 혹은 과소 발현하는 단백질을 고속으로 발굴하여 그 기능을 규명하며, 이를 통해 당뇨병의 진단과 치료의 표적 분자를 발굴하고자 한다. 이와 같은 유전체 기능연구를 통해 당뇨병 특이 유전자 혹은 단백질이 발견되면 이들이 유전적 표지자로 사용 가능한지를 검색한다. 본 연구결과 발굴되는 당뇨병 관련 유전적 표지자 혹은 유전자들은 DNA 혹은 protein chip으로 개발하게 될 것이다.